Het Strategie Evaluatie Protocol geeft richtlijnen voor het evalueren van onderzoek en onderzoeksbeleid. Alle onderzoeksinstituten en onderzoeksgroepen bij universiteiten worden een keer in de 6 jaar door een externe evaluatiecommissie beoordeeld op 3 criteria:
Ook krijgen aspecten als Open Science, Academic Culture, HR-beleid, en PhD-beleid aandacht in de evaluatie. Hiermee krijgen maatschappelijke ontwikkelingen, zoals het erkennen en waarderen van wetenschappers, een plek.
Ter voorbereiding op de onderzoeksevaluatie schrijft de onderzoeksgroep een zelfevaluatierapport. De evaluatiecommissie beoordeelt deze rapportage en bezoekt de onderzoekseenheid tijdens een zogenoemde site-visit. Samen met het zelfevaluatierapport vormt dit bezoek de basis voor het oordeel van de commissie.
Het Strategie Evaluatie Protocol 2021-2027 (SEP) is ontwikkeld door KNAW, NWO en VSNU.